当李自成攻破北京城时，明朝崇祯帝他恨臣子无能，恨自己生不逢时，走投无路之下，只得在煤山歪脖树上自缢。可是明末的那场规模巨大的鼠疫并没有随着崇祯死亡而消失，反而呈现出了愈演愈烈之势，这则又给了关外清军机会。

明末的鼠疫并不是凭空出现，而干旱则是诱因。对于靠天吃饭的古人来说，旱灾很可怕，因为这意味着颗粒无收，更会造成饿殍遍野的严重后果。而在每次的干旱之后，又会引起其他连锁的灾难，蝗灾和鼠疫是最为普遍的。

崇祯十四年，华北地区出现了范围巨大，时间超长的大旱，整整四年，百姓颗粒无收，整个华北地区如同人间炼狱，吃人的现象早已屡见不鲜。

一些走投无路的百姓为了生存，又大规模地加入李自成等人的起义军，此举又一刀子捅在了大明的七寸命脉。

随着李自成的军队越来越庞大，所需要的粮食也越来越多，连年干旱，谁家又有多少馀粮，于是难民的数量呈井喷式增长，一切能吃的，难民都不会放过，包括和难民一起逃难的老鼠，就这样，一场惊天的鼠疫在难民中悄无声息的蔓延开了。

其实在崇祯统治时期，鼠疫一直就没有消停过，不过前面几次天灾诱发的鼠疫，还在可控范围之内。但是这次鼠疫，在李自成大军四处征讨和难民八方逃荒中，开始大规模扩散逐渐呈现出现了井喷的状态。

正如《怀来县志》记载：崇祯十七年三月十五日闯贼入怀来，十六日移营东去，是年凡贼所经地方，皆大疫，不经者不疫。

当时并没有预防鼠疫的办法，吃不上饭的百姓，又怎么会有能力抵抗鼠疫？无可奈何之际，一批又一批的百姓倒下了，人间的炼狱又成为了老鼠的天堂，鼠疫愈演愈烈，直到无法抑制。

李自成攻破北京城之后，鼠疫也随之而来，这才使得这场鼠疫得以被载入史册，透过历史的记载，便能看到毛骨悚然的鼠疫。

《明通鉴》这般记载：京师大疫，死者无算……死亡枕籍，十室九空，甚至户丁尽绝，无人收敛者。这是这场瘟疫带来的后果，死者不计其数，十室九空，甚至有些家户，因为感染鼠疫全部死亡，连收敛尸体都没人。

《崇祯实录》又这般记载：京师大疫，死亡日以万计。这就是说当时的北京城，每天死去的人，多达上万人，这还是各方面都算比较好的都城，那么地方上因为鼠疫而死亡的人数，料来是个天文数字，只是史书未能记载罢了。

十室九空的情况之下，保卫京师的士兵也未能幸免，不仅人数骤减，而且战斗力直线下降，京师的防御早已形同虚设。

李自成不费吹灰之力攻破北京后，其实也不好过，在鼠疫的肆虐下，大顺军中每天也有大片士兵死亡。只是当时农民起义人数太多，使得李自成并没有很在意士兵减员的问题，可是随着清军入关，李自成的大顺军就很难匹敌了。灭亡了大明的李自成被清军打得抱头鼠窜，而清军则着实捡了一个大便宜，最终建立起中国历史上最后一个封建王朝。